قسم الشؤون الدينية
يتولى إلقاء المحاضرات الأخلاقية والفقهية والعقائدية على كل من الزوار والمنتسبين، وكذلك الإجابة عن الاستفتاءات الشرعية من قبل الزائرين، وفض النزاعات الاجتماعية وفقا لأحكام الشرع، وإجراء العقود والإيقاعات الشرعية، ويضم القسم شـُعب:شؤون التعليم والتوجيه الديني، الشؤون الاجتماعية، الاستفتاءات الشرعية.
قسم الاتصالات السلكية واللاسلكية
يدير القسم البدالة (إحدى شـُعبه)التي أنشأتها الإدارة لتسهيل تبادل المعلومات بين الأقسام والشـُعب والوحدات التنظيمية، ومراكزالتفتيش، وإدارة شبكة أجهزة الاتصالات اللاسلكية المنشأة حديثاً(ضمن شعبة الاتصال اللاسلكي)، للسيطرة بسرعة على أي طارئ أمني، ولتبادل المعلومات بين المنتسبين في مختلف الأقسام الخدمية في حال عدم تواجدهم في الغرف، حيث تغطي الشبكة عدة كيلومترات مربعة محيطة بالعتبتين المقدستين، كما استحدث القسم شعبة الصيانة والبرمجة لتقوم بأعمال تطوير وصيانة أجهزة القسم، كما تقوم بصناعة بعض الأجهزة الضرورية بكلف تقل كثيراً عن مثيلاتها الأجنبية وبنفس الكفاءة، كأجهزة كشف المتفجرات وجهاز معيدة الإشارة اللاسلكية وأجهزة الحماية الكهربائية، وغير ذلك، وباستخدام تصاميم الحاسوب.